许多东西本身对人体是有好处的，但是因为过量的摄入，也会导致出现反效果的。经常喝咖啡的话，会影响肾脏的不适，可能会出现尿频的情况。还会阻碍消化效果，容易出现胃病。
1.心脏。咖啡因以两种方式作用于心脏：除了影响调节心血管系统的大脑中枢，也直接对心脏产生作用。高剂量的咖啡因能使不耐受咖啡因的人每分钟增加 10~20 次心跳，并且可能使某些人短暂心律不齐。
因此，适度饮用含咖啡因(平均每天最多 500 毫克)的饮品，不会大幅提高心脏疾病风险，但超过这个剂量可能会增加患心肌梗死的风险。
2.肾脏。早上喝咖啡后爱上厕所，是许多人经常遇到的事。这是因为咖啡因会影响肾脏的腺苷受体，起到类似利尿剂的作用。咖啡因也可能减缓大脑释放一种减少尿液生成的抗利尿激素。
3.消化系统。咖啡中的酸质、油脂及咖啡因都可能刺激胃黏膜，并促进胃酸分泌，长期大量饮用含有咖啡因的饮品，会导致胃病。
4.呼吸系统。咖啡因及类似药物对于呼吸有两种影响，一是增加呼吸速率。此外，咖啡因可使气管周围的平滑肌放松，因而使气管扩张，增加呼吸量。但咖啡因不可以作为药物用于临床来治疗哮喘。
5.生殖系统。有研究指出，妇女怀孕期间喝咖啡，生下的婴儿出生体重较低。也有研究显示，服用咖啡因(相当于每天喝多于一杯咖啡)可能显著降低妇女受孕的机会。
